固相萃取技術基本原理是一個包括液相和固相的物理萃取過程。在固相萃取中，固相對分離物的吸附力比溶解分離物的溶劑更大。當樣品溶液通過吸附劑床時，分離物濃縮在其表面，其他樣品成分通過吸附劑床;通過只吸附分離物而不吸附其他樣品成分的吸附劑，可以得到高純度和濃縮的分離物。

　　固相萃取技術已經越來越廣泛地被應用在各種實驗室。然而，大部分用戶仍在用手動固相萃取。手動固相萃取一般是采用多個固相萃取柱一次同時進行多個樣品萃取。這就要求操作人員全神貫注，否則容易發生添加順序混亂，導致樣品作廢。其次，采用手動固相萃取容易造成樣品回收率重現性較差。在固相萃取過程中，樣品及洗脫液通過固相萃取柱的速度會直接影響的回收率及重現性。而在手工操作過程中，控制流速十分困難的。因此其重現性很難保證。此外，采用手動固相萃取所需時間較長。

　　自動固相萃取儀可以很好地彌補手動固相萃取儀的缺陷。首先，自動固相萃取儀嚴格按照系統設定程序進行，不會出現手工操作的錯誤。其次，自動固相萃取儀能夠準確控制液體流速，保證實驗結果的重現性。此外，自動固相萃取儀能夠運行多個不同的程序，建立的方法便于推廣及建立標準方法。因此，自動固相萃取儀不僅能夠降低實驗人員的勞動強度，更重要的是能夠保證結果的可靠性及重現性。目前國內許多實驗室要求按照GLP標準進行管理，這就要求所有的原始實驗數據都完整地保存，而自動固相萃取儀可以很好地保存已建立的方法及實驗數據，從而方便了按照GLP標準的管理。